一、院部机关管理机构

1.院办公室（党委办公室、院长办公室合署办公）

2.纪委办公室、监察审计室合署办公室

3.宣传部

4.教学工作办公室

5.科研工作办公室

6.学生工作办公室

7.人力资源部

8.财务部

9.医务部

10.门诊部

11.护理部

12.医院感染管理部

13.住院医师培训部

14.后勤部

15.基建部

16.安全保卫部

17.资产管理部

18.物资采购供应部

19.信息科

20.设备科

二、教学科研单位机构

1. 口腔内科学教研所

2. 口腔颌面外科学教研所

3. 口腔修复学教研所

4. 口腔正畸学教研所

5. 口腔基础教研所

6. 口腔医学基础实验室

7. 口腔医学专业实验室

8. 山东省口腔组织再生重点实验室

9. 骨代谢研究室

10. 组织工程与再生研究室

11. 图书馆（档案馆）

三、临床医疗单位机构

1. 牙体牙髓病科

2. 牙周病科

3. 口腔黏膜病科

4. 儿童口腔科、口腔预防科

5. 口腔颌面外科

6. 口腔修复科

7. 口腔种植科

8. 口腔正畸科

9. 口腔综合科

10. 保健科、综合二科

11. 急诊科

12. 麻醉科

13. 放射科

14. 检验科

15. 病理科

16. 药剂科

17. 消毒供应室

四、群团组织

1. 机关党支部

2. 口腔内科学党支部

3. 口腔颌面外科学党支部

4. 口腔修复学党支部

5. 口腔正畸学党支部

6. 工会、妇委会

7. 团委